ご夫婦で不動産を購入する場合のお話です。

住宅ローンを組み抵当権をつける場合に、２通り方法があります。
・【ペアローン】「債務者　ご主人」「債務者　奥様」となってそれぞれ融資を
　受ける。
　→抵当権は２本つきます。
　細かい話ですが、１番（あ）、１番（い）と同じ順位になることが多いです。

・【収入合算制度】「連帯債務者　ご主人と奥様」となり、お二人で融資を受け
　る。
　→抵当権は１本です。
　債務者２人いますが、２人で１人のイメージで、収入を合算してローンを組み
　ます。総額いくらの債務かが登記され、個別の債務がいくらかという概念はあ
　りません。目安として、負担割合があります。

さて、不動産を２人で購入する場合、持分で登記します。
この持分をどうするかというご質問を良くされます。

原則出資割合です。融資がなければ、４０００万円の不動産を３０００万円と１０００万円出資して購入したら、４分の３と４分の１です。

では、４０００万円の不動産を頭金１０００万円（ご主人４００万円、奥様６００万円）、夫が２０００万円、妻が１０００万円のペアローンで個別に借りた場合
ご主人　頭金４００万円＋住宅ローン２０００万円＝２４００万円
奥様　　頭金６００万円＋住宅ローン１０００万円＝１６００万円

結果、持分割合は夫２４００万円、妻１６００万円＝３：２
　　　登記では５分の３、５分の２と登記されます。（何％という表記はできません）

では、収入合算制度を利用して購入する場合、持分はどうなるでしょうか。
総額４０００万円の融資を２人で受けた（連帯債務）。
そうすると、それぞれの負担割合はお２人の負担割合によることになります。
仮にそれぞれの年収がご主人６００万円、奥様４００万円だとすると、

４０００万円のうち、２４００万円がご主人、１６００万円が奥様ということになります。

ここからは余談ですが、住宅ローンでは団体信用生命保険（団信）とセットになっていることが多いです。もし、債務者が亡くなられた場合、保険金がおりて、債務が完済となります。先の例で収入合算のケースだと、夫婦お２人で団信に入ることができます。ペアローンだと、夫婦のどちらかが亡くなっても、その方が債務者となっている抵当権しか抹消できず、もう一方の債務は引き続き残ります。
２人で団信に入った場合、夫婦のどちらかが亡くなると全額弁済されますので、残された者にとってはとてもいい制度だと思います。